Öt év telt el Ben 10 legutóbbi kalandjai óta és most, a 15 éves Ben Tennyson újra felcsatolja a szuper omnitrixet, génfegyver karóráját, amellyel képes átalakulni 10 idegen lény közül bármelyikké, megszerezve azok bizarr szupererejét. Unokahúgával, a mindig nyugodt Gwen Tennyson és a mindent kibíró egykor félelmetes riválisával Kevin Levinnel Ben küldetése három részből áll: megtalálni az eltűnt Max nagyapát, összegyűjteni és kiképezni egy tinédzser hősökből álló csapatot az eljövendő apokaliptikus harcra, és hogy tisztázza a félelmetes Csúcsvér intergalaktikus cselszövését, egy erőteljes idegen inváziót, melynek célja, hogy megsemmisítsenek minden intelligens életformát a galaxisban, kezdve a Földdel.